Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ColqO35348 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ColqO35348 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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ColqO35348 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ColqO35348 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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ColqO35348 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ColqO35348 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms