Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn9O35239 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn9O35239 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms