Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Psmd4O35226 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms