Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CckarO08786 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CckarO08786 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CckarO08786 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CckarO08786 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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