Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ube3aO08759 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube3aO08759 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ube3aO08759 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ube3aO08759 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ube3aO08759 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ube3aO08759 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ube3aO08759 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ube3aO08759 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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