Protein–RNA interactions for Protein: O08586

Pten, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtenO08586 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtenO08586 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtenO08586 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtenO08586 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtenO08586 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtenO08586 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtenO08586 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtenO08586 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtenO08586 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtenO08586 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtenO08586 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtenO08586 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms