Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MsmbO08540 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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