Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp35M0QWN7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms