Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms