Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8298J3QPI0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms