Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms