Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smim22J3QP37 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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