Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn34c2J3QNM1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn34c2J3QNM1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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