Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Top6blJ3QMY9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms