Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21818J3KMS6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21818J3KMS6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms