Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20828J3KMI7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20828J3KMI7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms