Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Srp72F8VQC1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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