Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atf6F6VAN0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atf6F6VAN0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms