Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms