Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa35E9QLQ1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms