Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmod3E9QA62 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms