Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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