Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pgbd1E9Q492 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pgbd1E9Q492 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pgbd1E9Q492 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pgbd1E9Q492 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms