Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tarbp1E9Q368 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tarbp1E9Q368 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms