Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20425E9Q035 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms