Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms