Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clca3bE9PUL3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms