Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms