Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Vpreb3D3Z6J4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms