Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rfx8D3YU81 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rfx8D3YU81 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx8D3YU81 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Rfx8D3YU81 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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