Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc5C3VPR6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms