Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfap1bC0HKD9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mfap1bC0HKD9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms