Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cspp1B2RX88 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cspp1B2RX88 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms