Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms