Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rrn3B2RS91 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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