Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brpf1B2RRD7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brpf1B2RRD7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms