Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slfn8B1ARD8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slfn8B1ARD8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms