Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem235B1AQL3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem235B1AQL3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms