Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930435E12RikA6X8Z9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms