Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubb1A2AQ07 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms