Protein–RNA interactions for Protein: A2ALC6

Gm4985, MCG8129, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4985A2ALC6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm4985A2ALC6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms