Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Frmpd1A2AKB4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmpd1A2AKB4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms