Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc183A2AJB1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc183A2AJB1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms