Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ambra1A2AH22 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms