Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frmpd4A2AFR3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms