Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdc27A2A6Q5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdc27A2A6Q5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdc27A2A6Q5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdc27A2A6Q5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdc27A2A6Q5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdc27A2A6Q5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdc27A2A6Q5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdc27A2A6Q5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdc27A2A6Q5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdc27A2A6Q5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdc27A2A6Q5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdc27A2A6Q5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms