Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Calcoco2A2A6M5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms