Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5538W4VSP6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5538W4VSP6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5538W4VSP6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5538W4VSP6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms