Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm4T1NXB5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm4T1NXB5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms