Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer1Q9Z2Y3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms